V CEMM sta dva presevna elektronska mikroskopa (JEOL JEM-2100 in JEOL JEM-2010F). Analitski
presevni elektronski mikroskop JEOL JEM-2010F je opremljen z vrstično enoto (ADF, BD STEM
detektorji), EDXS in EELS-om.
Jeol JEM-2100 (manual-2100)
- JED 2300 EDS
- Gatan CCD kamera ORIUS
- Analitski nosilci (double tilt)
- Nosilci za hlajenje in segrevanje (double tilt)

Jeol JEM-2010F (manual-2010f)
- FEG izvor elektronov
- STEM enota
- BF, DF STEM detektorja
- ADF/HAADF STEM detektor (Jeol YDF)
- Oxford Instruments ISIS 300 EDS
- Gatan PEELS 677
- Gatan CCD kamera SC1000B
- Analitski nosilci (double tilt)
- Nosilci za hajenje in segrevanje (double tilt)
